Laboratorio di Modellistica Molecolare e Computazionale

Laboratorio

  • Studi di modellistica molecolare volti alla progettazione in silico di composti bioattivi, mediante tecniche di structure-based e ligand-based drug design
  • Modellistica molecolare e predizione in silico della potenziale biodisponibilità e sicurezza/tossicità di piccole molecole
  • Ottimizzazione di composti come candidati farmaci 

 

Attività di ricerca 

  • Creazione di database in 2D e 3D
  • Analisi conformazionali di ligandi
  • Analisi e confronti bidimensionali e tridimensionale di proteine: comparazione sequenze primarie di proteine, creazioni di modelli proteici via homology modeling, analisi tasche per possibili interazioni con piccole molecole.
  • Studi di docking molecolare
  • Studi di structure-based virtual screening
  • Analisi 2D-QSAR e 3D-QSAR, mappe farmacoforiche
  • Valutazione in silico di parametri inerenti la farmacocinetica di candidati farmaci: parametri chimico-fisici solubilità, diffusione e assorbimento, passaggio a livello del SNC, binding alle proteine plasmatiche, interazione con citocromi
  • Valutazione in silico della sicurezza di composti bioattivi: gruppi tossicofori, inibizione del canale ERG, predizione test Ames genotossicità, predizione interferenti endocrini,
  • Predizione in silico del metabolismo di composti bioattivi, prodotti di metabolismo e ruolo come substrato/inibitore di citocromi 

 

Collaborazioni 

  • CNR di Pisa
  • CNR di Milano 

 

Componenti del laboratorio e persona di riferimento 

 

Ubicazione

Dipartimento di Farmacia (DIFAR) – Viale Benedetto XV, 3

 

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